Département Chimie et Biologie Structurales et Analytiques

Présentation du département

Le département de Chimie et Biologie Structurales et Analytiques de l’ICSN dispose de plusieurs thématiques de recherche ciblées autour de la chimie analytique et la biologie structurale. Il s’appuie sur un équipement exceptionnel et une forte expertise en modélisation moléculaire, cristallographie structurale, spectrométrie de masse, résonance magnétique nucléaire (RMN), biologie moléculaire/cellulaire et diverses méthodes de purification/analyse. Les projets menés reposent par exemple sur le suivi de la distribution de composés d’intérêt au sein de divers tissus ou matériaux biologiques, l’étude de mélanges complexes, la détermination de la structure de composés extraits de plantes ou de synthèse, la compréhension des mécanismes réactionnels, l’étude de la structure 3D et de la dynamique de petites molécules et macromolécules biologiques (seules ou en interaction avec des partenaires ou inhibiteurs) dans le contexte de la biologie structurale et de drug design.

Permanents du département

Nadine Assrir est chercheuse dans l’équipe "RMN, Chimie et Biologie Structurales" depuis 2012. Titulaire du DEA national de toxicologie (Paris Descartes) et d’un doctorat en biochimie, biologie moléculaire et cellulaire (Université Paris-Sud) préparé à l’Institut Gustave Roussy, elle s’intéresse à la relation entre la structure et la fonction des protéines ainsi qu’à l’incidence de cette relation sur les processus biologiques à la suite de modifications post-traductionnelles ou d’interactions moléculaires. A l’heure actuelle, elle étudie les répercussions, au niveau moléculaire, d’interactions sur des protéines impliquées respectivement dans la prolifération cellulaire (récepteur ErbB2), la réversion tumorale (Translationally controlled tumor protein TCTP) et la motilité cellulaire (inhibitor of apoptosis stimulating protein of p53, iASPP). Par ailleurs, elle est co-responsable de la plateforme FRISBI de production de protéines marquées en cellules eucaryotes associée à l’équipe. Enfin, Nadine Assrir est impliquée depuis plusieurs années dans l’enseignement de la biochimie à l’UVSQ, au niveau Licence et Master.

François Bontems est directeur de recherche (DR2) du CNRS. Après avoir fait son doctorat au Centre d’étude nucléaire de Saclay, sur l’étude de l’architecture des toxines de venin de scorpions, il a rejoint l’équipe de Jean-Yves Lallemand à l’Ecole polytechnique. il y a essentiellement travaillé sur un système couplant la traduction et l’inactivation d’ARN messagers lors de l’infection de la bactérie E. coli par le phage T4 (le système « RegB-S1 »). Il a ensuite intégré l’équipe de RMN de l’ICSN et partage actuellement son temps entre cette équipe et l’Unité de virologie structurale de l’Institut Pasteur. Son activité porte essentiellement sur l’étude des propriétés des protéines E et NS1 de Flavivirus (La fièvre jaune, la dengue, Zika), principales cibles du système immunitaire lors d’une infection. Pour ce faire il a développé et implanté à l’ICSN des outils permettant l’enrichissement en isotopes stables de ces protéines qui ne peuvent être produites en bactérie et le sont en cellules d’insecte et/ou de mammifère.Il est aussi organisateur de séminaires consacrés aux relations entre science et société et d’un cours Pasteur sur le même thème. Il est membre du comité de pilotage du Livre Blanc « Société, enseignement supérieur et recherche » préparé par l’ALLISS.

Alda da Costa est assistante en gestion financière, responsable administrative et financière pour les pôles de Gif-sur Yvette des plateformes RMNHC@UPSAY et Infranalytics ainsi que d’équipes de recherche. Elle a été recrutée à l’ICSN en 1999 en tant qu’AGT par concours externe (fonction d’agent technique de surface). Bilingue (français/portugais) et ayant déjà un diplôme de comptabilité, et elle s'est formée aux techniques de gestion et de bureautique dans la période 2000-2002. En 2003, elle a mis en place un secrétariat et réalise depuis des activités de gestion administrative et financière. Elle en pilote et coordonne certaines en lien avec des acteurs multiples : administratifs et gestionnaires de la DR4 et ICSN, personnels scientifiques internes et externes. En 2023, elle réussit le concours interne d'Assistante Ingénieure valorisant l'intégralité de son parcours. En dehors du travail, Alda aime les randonnées, la gastronomie et les vins et s’occuper des personnes âgées.

Claire de March chargée de recherche au CNRS (CRCN). Elle a suivi une formation en sciences et industrie des arômes à l’ISIPCA de Versailles et a eu une expérience industrielle en tant qu’analyste sensorielle dans le groupe Bel. Elle a obtenu son doctorat à l’Université Nice Côte d’Azur en 2015 où elle a étudié les mécanismes moléculaires impliqués dans la reconnaissance des molécules odorantes par des récepteurs olfactifs. De 2016 à 2022, elle a rejoint le laboratoire de Hiroaki Matsunami de Duke University (NC, USA) pour continuer à étudier comment les récepteurs olfactifs sont utilisés pour déclencher une perception olfactive cette fois ci du côté expérimental. Depuis 2022, elle a rejoint l’ICSN en tant que chargée de recherche CNRS. Elle utilise la synergie des approches in silico et in vitro pour établir le lien entre la structure chimique d’une molécule odorante, les processus biologiques impliqués et la sensation qu’elle provoque. Elle s’intéresse particulièrement au rôle des motifs d’acides aminés conservés au cours de l’évolution chez les récepteurs olfactifs et comment ils définissent leur identité et leur structure au sein de la famille GPCR. En dehors du laboratoire, elle pratique de nombreux types d’artisanat et la boxe thaïlandaise et aime se détendre avec ses amis et sa famille.

Nicolas Elie est ingénieur d’étude au CNRS.

Jean-François Gallard est ingénieur d’étude.

Diego Gauto a obtenu son master en chimie (2009) et son doctorat en biologie computationnelle (2013) à l’école des sciences de l’Université de Buenos Aires, en Argentine. Immédiatement après son doctorat, il a effectué un postdoctorat en RMN des solutions à l’Institut de biologie moléculaire et cellulaire de Rosario (IBR), en Argentine, puis a déménagé en France pour commencer un poste postdoctoral à l’IBS (Institut de biologie structurale) avec Dr Paul Schanda pour étudier la structure et la dynamique des protéines par RMN à l’état solide et développer des méthodes d’élucidation structurale combinant RMN et CryoEM. Ensuite, il poursuit sa formation postdoctorale avec les Drs Sabine Hediger et Gaël De Paëpe au CEA, Grenoble afin de réaliser de la RMN à températures cryogéniques et en conditions DNP. Depuis 2020, il est chargé de recherche CNRS à l’Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), à Gif-sur-Yvette, où il s’intéresse à comprendre les bases structurales des cages protéiques et leur application en chimie et santé.

François Giraud est ingénieur de recherche.

Vincent Guérineau est ingénieur de recherche au CNRS.

Bogdan Iorga est directeur de recherche au CNRS.

Eric Jacquet est chargé de recherche au CNRS.

Ewen Lescop is a CNRS senior scientist. He received his Ph.D. at the ICSN in the group of Eric Guittet, with a work on a honeybee odorant-binding protein. He then performed postdoctoral research at Beijing University (2004-2006, C. Jin, China) and the Institute of Structural Biology (2006-2007, B. Brutscher). In 2007 he returned to the ICSN to develop NMR methods for proteins and study a variety of biological systems with structural-biology approaches. Outside the lab, Ewen is a keen and active player of traditional folk music, especially breton music, and he always likes a good meal and a drink.

Nelly Morellet occupe un poste d’ingénieur de recherche à l’ICSN (CNRS-IRHC). Elle a obtenu un doctorat sous la direction de Jean-Claude Beloeil en 1989 à l’ICSN. De 1990 à 2010 elle a étudié par RMN plusieurs protéines virales (VIH-1, SIV, Birnavirus, Rotavirus…) dans l’unité de B.P Roques puis D.Scherman à la Faculté des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Paris. En 2010 elle a intégré l’équipe de Chimie et Biologie Structurales, à l’ICSN. Elle est impliquée dans plusieurs projets : la résistance aux antibiotiques (protéine NDM-1 et RNaseY), les transposases et transposases domestiquées (protéines PiggyBac et PiggyMac), et des protéines et récepteurs surexprimés dans le cancer du sein (ErB2).

Annie Moretto est technicienne au CNRS.

Hristo Nedev est ingénieur de recherche au CNRS.

Naïma Nhiri est ingénieure de recherche au CNRS.

Salomé Poyer est chargée de recherche au CNRS (CRCN). Ses travaux portent sur le développement de méthodes permettant de caractériser les structures isomériques des lipides par spectrométrie de masse. Comme la plupart des caractéristiques isomériques structurelles sont accessibles par des clivages de liaisons C-C, ses intérêts de recherche portent sur la réactivité en phase gazeuse avec les métaux de transition et les techniques d’activation alternatives pour générer des dissociations radicalaires. Elle développe également des méthodes utilisant la spectrométrie de mobilité ionique pour résoudre les barrières isomériques spatiales.

Pascal Retailleau est ingénieur de recherche au CNRS.

Christina Sizun a obtenu un doctorat en chimie physique en 2000 à l’Université Louis Pasteur à Strasbourg, où elle a appris la RMN de systèmes catalytiques. Elle a ensuite rejoint le groupe de Burkhard Bechinger à l’Institut Max Planck de Biochimie à Martinsried en tant que post-doc pour travailler en RMN du solide de peptides membranaires. Après un second post-doc chez Erick Dufourc à l’Institut Européen de Chimie et Biologie à Bordeaux, elle a été recrutée en 2003 en tant que chargée de recherche à l’ICSN, où elle a pu développer son intérêt pour la biologie structurale par RMN. Ses thématiques de recherche sont centrées sur la relation structure-fonction de protéines virales (virus respiratoire syncytial) en tant que membre d’un réseau collaboratif incluant l’INRA et l’Institut Pasteur. Elle participe aussi à l’un des projets dédiés aux cibles thérapeutiques du LabEx LERMIT (modulateur de l’axe de signalisation CXCL12/CXCR4). Elle s’investit dans l’enseignement de la RMN biologique et la biophysique dans plusieurs cursus universitaires.

Carine van Heijenoort est directrice de recherche au CNRS. Après un cursus en chimie à l’école normale supérieure de Saint Cloud – Lyon, elle a obtenu son doctorat en 1994 à l’ICSN sous la direction de Eric Guittet sur l’étude de la flexibilité interne d’une protéine toxine de plantes par RMN. Elle a été recrutée au CNRS en 1994 à l’ICSN, est allée faire un retour aux sources à Utrecht dans le groupe de Rob Kaptein et Rolf Boelens en 1999-2000 pour explorer la culture néerlandaise et les interactions protéine-protéine. De retour à l’ICSN, ses axes de recherche sont centrés sur la caractérisation des états multiples des protéines, avec un intérêt plus particulier autour des protéines intrinsèquement désordonnées et leurs interactions. Elle est actuellement coordinatrice du département de Chimie et Biologie Structurales et Analytiques de l’ICSN. En dehors du laboratoire, Carine est la maman de trois merveilleuses filles, elle pratique activement l’équitation, aime les chiens, les chats, la musique, la lecture et les discussions entre amis.