Équipements disponibles sur la plateforme QPCR
La plateforme dispose de tous les équipements et logiciels nécessaires à la réalisation des différentes étapes de votre projet de PCR quantitative, de la conception et design des sondes jusqu’aux analyses des données des résultats des QPCR.
Différents appareils de QPCR sont disponibles pour s’adapter aux besoins des projets selon le nombre d’échantillons et le nombre de gènes cibles d’intérêt pour chaque projet.
Les deux principales techniques de QPCR, en sondes SybrGreen ou TaqMan, peuvent vous être proposées pour la réalisation de votre projet.
PRECELLYS 24 CRYOLYS
Ce broyeur (Bertin) permet l’extraction d’ARN/ADN de tissus humain, animal, végétal et de microorganismes. 24 échantillons peuvent être broyés simultanément dans des tubes à usage unique. Ce broyeur est équipé de l’option Cryolys pour contrôler la température des échantillons durant leur préparation.
NANODROP ONE
Ce spectrophotomètre (Thermofisher) permet la quantification rapide des échantillons acides nucléiques en utilisant de très faibles volumes de 1-2 µl. Ce nouveau modèle, permettant d’obtenir des informations quantitatives et qualitatives des échantillons, est en cours d’acquisition sur la plateforme.
BIOANALYZER 2100
Le Bioanalyzer 2100 (Agilent) réalise des électrophorèses capillaires sur puces microfluidiques des échantillons ARN et ADN. Le logiciel attribue un score RIN qui indique la qualité des échantillons. Ce contrôle est essentiel pour la bonne réalisation des projets de PCR quantitative.
7900HT FAST REAL-TIME PCR
Cet appareil de PCR quantitative est équipé pour les projets en format microplaques 96 et 384 mais il permet également de réaliser les projets utilisant les cartes microfluidiques TaqMan Array Card (Thermofisher). L’introduction des plaques est automatisée par le robot de chargement ce qui permet un débit d’environ 5000 QPCR par jour.
QIACUBE
Le Qiacube (Qiagen) est un système automatisé permettant la purification sur colonne des échantillons ARN et ADN utilisés pour les projets de PCR quantitative sur la plateforme. Différents protocoles sont disponibles selon la nature des échantillons.
QUBIT
Le Qubit (Thermofisher) est un fluorimètre permettant un dosage spécifique et sensible des différents acides nucléiques purifiés et utilisés pour les projets de PCR quantitative.
EPMOTION 5075
Le robot epMotion 5075 (Epppendotf) est un automate de pipetage utilisé sur la plateforme pour toutes les étapes de manipulation des échantillons et de préparation des plaques de PCR quantitative en format 96 et 384.
STEPONEPLUS
La plateforme dispose de deux StepOnePlus (Thermofisher) pour la réalisation des projets de QPCR en format microplaques 96. Ces appareils sont également utilisés pour l’optimisation des couples d’amorces pour les projets développés en SybrGreen.
QUANTSTUDIO 12K FLEX
La plateforme est équipée d’un appareil de QPCR QuantStudio 12K Flex (Thermofisher) équipé d’un bloc Open Array et de son robot de chargement Accufill. Cet appareil permet de traiter des projets à haut-débit avec une capacité de 12 000 réactions par run de 2H00 dans un volume réactionnel de 10 à 33 nl.