Équipements disponibles sur la plateforme CTPF
Les expériences de Thermal Shift Assay sont réalisées sur des appareils de PCR quantitative qui permettent d’appliquer un gradient précis de température sur les échantillons et de suivre en temps réel l’évolution de la fluorescence dans les puits de la microplaque.
Selon le type de machines et les logiciels qui les pilotent, les possibilités d’appliquer des gradients peuvent être différentes, le format des microplaques est en 96 ou 384 puits, de même les longueurs d’ondes d’excitation et les filtres d’émission diffèrent sur ces machines.
Nous disposons sur la plateforme de différents modèles de machines de PCR quantitative ce qui nous permettra en fonction des besoins d’optimiser les expériences souhaitées pour votre projet.
Pour les projets de criblage nécessitant un nombre important de microplaques à réaliser et donc de très nombreuses courbes de dénaturation à comparer, nous disposons d’un logiciel d’analyse performant pour l’analyse et faire la synthèse des résultats obtenus.
EPMOTION 5075
Le robot de pipetage Eppendorf epMotion 5075 est utilisé sur la plateforme pour le remplissage des microplaques 96 ou 384 puits pour toutes les offres de prestations de Thermal Shift Assay.
Cette plateforme est équipée de têtes de pipetage mono- et 8-canaux ainsi que de 12 positions de travail. Le robot est équipé de 2 thermomodules qui assurent le contrôle de température des échantillons protéiques durant la distribution des microplaques.
STEPONEPLUS
La plateforme dispose de deux StepOnePlus (Thermofisher) pour la réalisation des projets en TSA en format microplaques 96.
Ces appareils sont équipés de 6 blocs peltiers indépendants nous permettant d’enregistrer la cinétique de dénaturation des échantillons protéiques à des températures différentes sur la même microplaque.
7900HT FAST REAL-TIME PCR
Cet appareil de PCR quantitative utilisé pour les expériences de Thermal Shift Assay est équipé de blocs peltiers adaptés aux microplaques en format 96 et 384 puits.
L’excitation du fluorophore est produite par un laser à 488 nm et l’émission enregistrée par lecture du spectre entre 500 et 660 nm.
QUANTSTUDIO 12K FLEX
La plateforme est équipée d’un appareil de QPCR QuantStudio 12K Flex (Thermofisher) également utilisé pour les expérience de Thermal Shift Assay en format 96 et 384 puits.
Sur cet appareil de nombreuses combinaisons de filtres sont possibles en excitation et en émission. De plus, une fréquence de lecture élevée des échantillons permet d’accéder à des cinétiques rapides de dénaturation.
QUBIT
Le Qubit (Thermofisher) est un fluorimètre permettant le dosage des échantillons protéiques utilisés pour les projets de Thermal Shift Assay sur la plateforme.